Краеведческая библиотека — одно из старейших подразделений музея. Основу библиотечного фонда составили книги четырех вологодских музеев, объединенных в 1923 году в единое государственное учреждение. На основании приказа Министерства культуры РСФСР № 45 от 6 апреля 1979 года раритетная литература была передана в сектор письменных источников музея. В библиотеке около 40000 изданий по истории, природе, культуре и искусству. Значительная часть материала связана Вологодским краем. Библиотека включает подборку периодических изданий Вологодской губернии (Вологодские губернские ведомости, Вологодские епархиальные ведомости, памятные книжки). Библиотека доступна не только научному коллективу Вологодского государственного музея-заповедника, она может принять исследователей из других учреждений науки и культуры, общественных и религиозных организаций, студентов. Им может временно предоставляться право безвозмездного пользования библиотекой по специальному разрешению администрации музея (это преподаватели, аспиранты и студенты-дипломники вологодских ВУЗов, сотрудники музеев, центров традиционной народной культуры и другие).
Реставрационные мастерские
История реставрации движимых памятников в музее Вологды ведет свой отсчет с самого начала
Отсутствие финансирования заставило прервать эту деятельность на долгих 9 лет. Возможность возобновить реставрационные работы в музее и вновь пригласить А.И. Брягина появилась лишь в конце 1939 года, накануне грядущей Великой Отечественной войны. Реставрационные работы в военные годы не прекращались, более того, в конце 1943 года у А.И. Брягина появился ученик и преемник — Н.И. Федышин, проработавший в музее до 1999 года и взрастивший достойную смену. До середины
В настоящее время в музее работают два художника-реставратора темперной живописи I категории, реставратор по текстилю I категории, реставратор масляной живописи II категории и два неаттестованных реставратора, осваивающих новые для мастерской музея направления. Музейных реставраторов отличает трепетное отношение к памятникам и стремление обеспечить дальнейшую жизнь и сохранность предмета, внося в его структуру минимальное количество новых синтетических материалов, т. е. для консервации произведений; по возможности используются традиционные клея, уже присутствующие в структуре памятников. Ежегодно проходят полный реставрационный цикл в музейной мастерской
Таксидермическая мастерская
Изготовление таксидермических скульптур для экспозиций, выставок, фондов музея согласно планов выставочной деятельности. Большинство экспонатов зоологической коллекции музея, насчитывающей сегодня 1603 предмета основного фонда и около 1000 экспонатов научно-вспомогательного, изготовлены силами сотрудников таксидермической мастерской музея. Чучельщик–препаратор появился в штате музея в 1924 году, а в 1928 году при естественно-историческом отделе музея уже имелась специальная чучельно-препаровочная мастерская, выполнявшая работы по набивке чучел и монтировке биологических групп. Она изготавливала в среднем 18 чучел в год.
Сотрудниками этой мастерской были препараторы — Сергей Михайлович Каранчаев
Помимо пополнения зоологической коллекции Вологодского музея, таксидермистами были изготовлены чучела для музеев области: Велико-Устюгского, Устюженского, Вытегорского, Сямженского, Кирилловского, Нюксенского, музея леса города Вологда и других. В настоящее время в таксидермической мастерской музея работает один таксидермист Сергей Владимирович Шварков, музейная коллекция пополняется десятком таксидермических скульптур в год.
Фотолаборатория
Невозможно представить деятельность музея без работы фотографа, которая сопровождает каждый музейный предмет и мероприятие: сначала документальная съемка в экспедиции, процесс изучения и подготовки к экспонированию, затем любопытные кадры запечатленных экспозиций и мероприятий и, наконец, высококачественная и художественная съемка для публикации в различных изданиях... Фотографами-любителями были многие сотрудники музеев: С.А. Непеин во времена Древлехранилища, И.В. Федышин в
Первым штатным фотографом музея был Ерофей Александрович Тихомиров. Его фотографии 1946 –