В среднем высоком этаже находились парадные апартаменты, Христорождественская церковь (упраздненная во второй половине XVIII в.), личные покои архиерея и кельи монахов, служивших при доме. В подклете помещались кухни, хлебопекарни, трапезная низших служителей, кладовые и т.п. На самом верху жили лица, обслуживающие дом, и хранились домовые запасы; над церковью была архиерейская ризница.
Самым парадным помещением архиерейского корпуса была большая приемная, так называемая Крестовая палата, с семью слюдяными окнами, в которые были вставлены железные решетки.
Палата была увешана образами в богатых окладах и ризах; тяжелое медное паникадило свешивалось со свода. На архиерейском месте, обитом темно-зеленым сукном, лежала золотая бархатная подушка. В
В нем размещаются экспозиции отдела природы и отдела истории.